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山舞银蛇，原驰蜡象
今天给大家分享一篇16年发表在nature communications上的文章，研究的是五步蛇的进化。
蛇跟其他四足动物相比有很多的特征和较为丰富的基因组进化历史，但是这些目前尚不清楚。文章构建了一个高质量的五步蛇基因组，并通过和其他代表的蛇类还有蜥蜴进行了比较基因组学分析，重点研究了进化中TE的影响，TE影响的脑特异性基因的表达等。另外还检测到蛇明显的适应化的进化，包括和毒液、热敏感基因的的显著变化，还有跟视觉相关基因的退化等。文章还找了Hox、Tbx等和四肢发育相关的基因处于退化状态，说明蛇之前也是有四肢的，当然这一点被化石也证明过。最后，文章推测ZW性染色体发生了至少三次重组抑制事件。种种这些研究对于蛇物种的进一步理解和研究都有重要的意义。
世界上一共有3400种蛇，除了极端环境之外，绝大地区都有蛇的分布。蛇的进化过程存在很多的变化，比如身体结构的变化、毒液的变化、生殖系统的变化等，整体这些变化使得其和蜥蜴看起来具有明显的区别。从化石中可以得到的证据是曾经的蛇已经有较为长的身体，这是为了挖洞爬行，但是其之后前肢丢掉了，后肢尚存。目前蟒蛇还有退化的后肢，然后进化较快的蛇已经丢掉了它。
蛇也经常被用来作为四肢进化研究、毒液研究、性染色体进化研究的模型。五步蛇不同于其他蛇，其有较为明显的ZW染色体、明显的尖牙，剧毒（五步蛇嘛），这些是跟其他蛇不同的。
为此，文章利用其和已发表的蟒蛇2个、眼镜王蛇、还有蜥蜴进行了比较基因组学分析。发现蛇和蜥蜴相比GC含量明显不同，这大概是因为TE家族导致的。文章也找到了适应性相关的基因，比如毒素相关的基因，还有就是跟四肢发育、视觉等相关基因的放松选择等。整体推测蛇的ZW染色体上至少发生3次重组抑制事件。
参考文献
Yin W, Wang Z J, Li Q Y, et al. Evolutionary trajectories of snake genes and genomes revealed by comparative analyses of five-pacer viper[J]. Nature Communications, 2016, 7:13107.
