在以前的文章中也讲过如果利用orf finder和transcoder进行orf预测，但是实践证实两款软件效果不是很好，并且通常会有多个orf序列，分析人员通常不知道那个是最好的。

目前有一款软件bestorf，其首页如下：

生信人收录地址：http://gps.shengxin.ren/

官网：http://www.softberry.com/berry.phtml?topic=bestorf&group=programs&subgroup=gfind

这个软件目前是收费状态，但是官网支持一次一个转录本进行orf预测。

软件界面如下：

需要输入两个信息

第一个是转录本fa数据，可以直接粘贴也可以输入文件。这里跟其他软件一样。

第二个是选择输入的物种，用输入的物种来进行参数训练，支持很多物种，这可能是跟其他软件不一样的地方，这里你可以理解为利用了人工智能的方法来自动提取特征帮你选择最好的orf。

然后点击search

跳转网页，结果如下：

小编有话说：小编跟你讲这个软件虽然收费，但是其确实确实很牛叉，在小编项目过程中，总有一些疑难杂的基因找不到合适的orf，但是利用这个工具还真的找到了，你不信 ，我建议你试试。

当然这个softberry公司不仅仅这个工具好，其他的工具也很好，接下来小编可能会手把手的告诉大家他家那些东西好，并且告诉大家如何使用~~~

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