首先让我们来看一下小编收集的2004年到2017年3月份已发表的基因组文章统计趋势图(图1)。
图1 基因组文章发表趋势
在2004年到2017年的发展过程中,很明显能看出2009年开始发力,一直到2015年,6年时间基因组呈现“指数型”上升趋势,在2015年之后趋于冷静。这一波主要动力在于二代测序技术的发展,相比一代测序,二代测序的通量超高、费用更低。
在2015年之后,基因组的文章减少,基本维持在几十篇左右,其原因在于二代测序基因组已经普及化,技术缺乏新颖,在基因组领域的深度挖掘越发困难,产生的文章数量也就会降低。但是2015年正是三代测序迅速发展的一年,仔细研究2015年之后的基因组趋势,可以发现三代基因组占比越来越高。从12%到24%再到2017年的100%(以目前数据分析是100%),可以看出基因组文章以后基本就得三代起步了。
图2 三代测序在基因组文章中的比重
2017年以后哪些物种会发基因组文章呢?关于这个话题,小编认为满足以下几种情况的物种应该会得到更多的关注。
1. 特大物种仍然火热
这一部分物种是以重要的经济作物为代表的,比如水稻、棉花、玉米等等。虽然这些物种的热度已经很高,但是在新技术普及开的时候,他们应该依然炙手可热。
2. 一线物种温度不降反升
一线物种是指较为重要的物种,这些物种的研究地位也较为重要,但是还没有热到特大物种的程度,对于这一类物种,17年研究应该是一个热点问题,因为测序便宜了,基因组也是可以搞一搞的啦。
3. 一线物种周边物种热度提升
对于重要物种的其他亚种、其他品种、以及与之相关的物种,确实存在因为重要物种的热度而被带动起来的可能性。这些物种在17年应该也会被大量研究。
4. 多年没有研究的物种将强势抬头
这些物种大多属于较为复杂的物种,比如超大基因组、超级复杂的基因组,原来的测序技术无法搞定,借助这批新的改革的春风,这些一直待在冷宫的物种,也存在飞上凤凰的可能性。
下面是截止到3月25日已发表的动物和植物基因组,统计结果难免有所疏略,但是其指导意义应该存在,分享给大家,供参考。
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