18年生信人推出了一个课程基因家族的分析课程,这个课程售价1分钱,到现在已经销售了3000份了。
同时我们遇到了一个问题,大家普遍反馈视频讲解有些单调,缺少互动。另外对于视频中讲解大多受限于套路,而对于真刀真枪的生信技能涉猎的较少。
其实基因家族分析是比较基因组学的一个简单得应用,可以说是比较基因家族分析。
对于想研究深入研究基因家族分析的童鞋们,系统学习下比较基因组学的各种分析还是很有必要的。
基因课的张旭东,我们一直合作的老朋友,听说他要打平安县,我们也要帮帮场子。
推荐想系统学习比较基因组学分析的小伙伴,考虑下东哥的开学第一课。
基因组与比较基因组专题培训班
基因课培训班第十二期 | 武汉 | 3月20 - 24日
单期报名费用4500
超级年会员9900,尊享10+期免费
详情,扫码咨询
张大咖
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课程安排
推荐动植物研究者参加;适合零基础学员参加;
通过五天的学习可以自行完成基因组拼接、注释和常见比较基因组学分析;有基础的学员可选择参加后三天课程
课前预习
提前预习基因课视频(www.genek.tv)、安装软件
1. 视频课程:《生物信息入门之 Linux》
2. 视频课程:《生物信息软件安装》
3. 视频课程:《测序数据过滤和质控》
4. 服务器安装:blast、fastp、Soapdenovo
5. 个人电脑安装:Mega
第一天
Linux 基础
1. 测序原理:illumina、PacBio、Nanopore、MGISeq
2. 计算机基础:CPU、内存、硬盘、核、进程、线程、并行计算等
3. Linux 常用命令
4. 生物信息软件安装:手动安装、自动安装
第二天
任务实操
1. 高级命令:grep、sort、awd、sed 等
2. 任务练习:测序数据过滤和质控
3. 任务练习:基因家族分析
第三天
基因组拼接
1. 基因组Survey:基因组大小、杂合度、重复序列含量评估
2. 拼接策略制定:二代、三代、Hi-C等
3. 拼接原理
4. 拼接软件:SOAPdenovo、canu、pilion 等
第四天
基因组注释
1. 重复序列注释:RepeatMasker
2. 基因结构注释:Maker 和 BRAKER 自动化流程
3. 基因功能注释:eggnog-mapper 结合自主开发流程
第五天
比较基因组
1. 基因家族鉴定:orthofinder
2. 共线性分析:MCscanX
3. 进化树构建和美化
讲师介绍
一线工程师、CNS一作授课
基因课介绍
成立于 2017年7月,专注于生物信息学培训。
基因课网校:已完成 14 门视频课程的开发,累计学员 3000 余人。
线下培训班:武汉、成都、西安、杭州、广州、北京等地举办快速入门班 11 期、周末成长班 2 期,累计培训学员 500 余人。
主讲老师 张旭东
曾任华大基因项目组组长、产品研发组组长。
2014年合伙创办贝纳基因,担任CTO。
2017年创办基因课,专注生物信息学培训。
发表文章:麻疯树基因组计划(the plant journal)、鹰嘴豆基因组计划(Nature Biotechnology)、 芝麻基因组计划(Genome Biology)、猕猴桃群体研究(New Phytologist)。
单期报名费用4500
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