-m alignment view options: 比对显 示选项,其具体的说明可以用以下的比对实例说明
0 = pairwise,显示具体匹配信息(缺省)
1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域,显示一致性
2 = query-anchored no identities,查询-比上区域,不显示一致性
3 = flat query-anchored, show identities,查询-比上区域的屏文形式,显示一致性
4 = flat query-anchored, no identities,查询-比上区域的屏文形式,不显示一致性
5 = query-anchored no identities and blunt ends,查询-比上区域,不显示一致性,无突然的结束
6 = flat query-anchored, no identities and blunt ends,查询-比上区域的屏文形式,不显示一致性
7 = XML Blast output,XML格式的输出
8 = tabular,TAB格式的输出
9 =tabular with comment lines,带注释行的TAB格式的输出
10 =ASN, text,文本方式的ASN格式输出
11 =ASN, binary [Integer] default = 0,二进制方式的ASN格式输出
-m 8 用法举例说明如下:
结果12列
Query id,Subject id,% identity,alignment length,mismatches,gap openings,q. start,q. end,s. start,s. end,e-value,bit score
提供两个小工具,一个是m7转m8的程序,一个是m0转m8的程序。
http://pay.shengxin.ren/article-id-362.html
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