好多人想去做某一项分析,但是不知道有没有现成的软件可以做,或者有好多软件,我不知道如何选择哪一个软件。只有解决这两个问题,我么才可以迅速分析,得到想要的结果。
那么如何解决这个问题呢?小编主要推荐一个一个网站:
OMIC TOOLS:https://omictools.com/
一、有没有现成的软件?
进入主页,此网站列出了各种分析模块:
然后选择相应的分析模块,进入即可。此处我们选择高通量测序这个模块:HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING。进入后显示如下界面:
这个界面列出了此模块分析内容对应的工具,直接进行查看即可。此处我们选择RNA-seq analysis。进入后显示如下界面,可以看到显示RNA-seq分析的各项分析内容,只需要点击我们想要分析的即可,里面有众多对应的工具。
二、如何选择工具?
以选择Spliced read alignment 为例,进入后列出了各个软件,部分软件示例如下。每个软件我们看到都有简单介绍,对比一下各个软件选择即可
以Tophat为例进入,每个软件我们看到都有简单介绍,对比一下各个软件即可。同时点击左上方Tophat,直接进入下载页面。
同时我们也要关注软件发表的期刊,确定最佳软件。
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