现在越来越多的人开始做转录组了,毕竟他确实是一个挖掘功能基因的有效工具。但是目前仍然有大量的老师把转录组分析交给公司,进行付费分析。但在小编看来,转录组分析已经非常成熟,且资源消耗已经非常小,笔记本都可以完成。因而无论在硬件还是软件方面,自己分析都成为可能,而且周期也会得到明显的保证;
同时对于具有基础生信分析水平的人来说,没必要在这些分析步骤上浪费时间,更重要的是要挖掘分析结果。因而拥有一套转录组一键式分析流程,快速准确的分析是必要的。
目前生信人联合众粉丝们推出一套一键式有参转录组分析流程,为大家节省科研经费,提高分析效果,加快科研产出。即可获得安装与使用培训及结果解读。
流程主要分析结果概述:
测序数据及其质量控制。
比对
基因表达定量
差异表达分析:火山图(Volcano Plot),韦恩图
差异表达基因聚类分析:热图
差异表达基因GO注释
差异表达基因KEGG注释:散点图
差异表达基因富集分析
可变剪接分析
新转录本的预测
同时期望您做一下调研,方便我们改进。
TCGA | 小工具 | 数据库 |组装| 注释 | 基因家族 | Pvalue
基因预测 |bestorf | sci | NAR | 在线工具 | 生存分析 | 热图
生信不死 | 初学者 | circRNA | 一箭画心| 十二生肖 | circos
舞台|基因组 | 黄金测序 | 套路 | 杂谈组装 | 进化 | 测序简史