5+ 新冠联合肿瘤网络药理学分析方案
生信干货
sxr ·2020年11月17日 02:11
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1.公共数据库获取癌症表达数据，获取COVID-19相关基因。2.差异表达分析筛选差异基因DEG，与COVID-19相关基因取交集作为CAN/COVID-19 Gene。
4.1.蛋白互作网络构建（基于drugbank，蛋白互作数据库，CAN/COVID-19 Gene构建互作网络）。
4.2.药物与肿瘤网络接近度分析，获取潜在药物（计算公式参考文献，结果排序，优先选择最显著的1-3个药物进行后续分析，注意，如果这部分结果不好，则考虑到drugbank COVID-19板块选择候选药物进行后续分析）。
5.候选药物靶点识别，与CAN/COVID-19 Gene交集分析
9.药物-CAN/COVID-19综合调控网络构建
1. Cancer patients in SARS-CoV-2 infection: a nationwide analysis in China2. Network Pharmacology and bioinformatics analyses identify intersection genes of niacin and COVID-19 as potential therapeutic targets3. Screening novel drug candidates for Alzheimer’s disease by an integrated network and transcriptome analysis生信人提供新颖、正规、可复现的
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