近期Nature communication 上线一篇文章,主要是研究eRNA(增强子RNA(eRNA)是一种从增强子转录的非编码RNA。)
文章题目
Transcriptional landscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy in cancer
文章通过自己数据结合公开数据库TCGA、ENCODE、CCLE、CTRP(癌症治疗数据库)、GDSC等数据库构建了迄今为止最全面的一个eRNA 数据库,同时研究了eRNA在30种癌型的特征(lanscape)。
一、文章研究了eRNA在人类癌症中的表达和特征
二、分析了TF因子和eRNA的关系
三、eRNA在癌症中的功能和药物作用
四、与临床相关的eRNA
五、搭建了eRic分析平台
在这个平台上可以做TCGA中肿瘤中的eRNA的表达,临床预后,eRNA对应的靶基因,eRNA对应的药物的在线分析,还提供全部数据的下载。
这个对于大家日常的生信研究,课题设计具有很大的帮助。
不多说了,大家抓紧研究吧。
网址:https://hanlab.uth.edu/eRic/
参考资料
Zhang Z1, Lee JH1, Ruan H1,et al.Transcriptional landscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy in cancer.Nat Commun. 2019 Oct 8;10(1):4562. doi: 10.1038/s41467-019-12543-5.
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