生信发文章的另外一种骚操作
生信干货
sxr ·2020年7月7日 23:27
作为生信人，小编只知道生信发文章分为三种情况，第一种是纯生信分析，或者干湿结合，这种用的最为广泛，接受程度最高。第二种是生信数据库开发，这种属于白求恩类型，我们之前学校超级喜欢用这种，纯手工打造，耗时巨久的受累讨好方法，比较少见。第三种，就是针对某种数据，某类问题，开发了新的算法或者软件，这种要不分析结果更优秀，要么图片更漂亮。但是呢，今天小编看到了另外一种模式，算是开了眼界。Gigascience上发表文章（technolog note）Galactic Circos: User-friendly Circos plots within the
Galaxy platform看标题就知道了，这货开发了一个界面的circos工具。大概文章内容说这个circos 是基于unix的 好多科研用户不会用，存在使用成本。（老大，window 下也可以使用的，拜托多做做功课。）问题是简单的circos绘制，可以去circos官网上，人家已经提供模板，可以在线操作。所以对于简单的circos，这个Galactic Circos没啥用。然后就是复杂的circos绘制，这个复杂一般在于数据比较多，参数设置比较复杂，circos提供了配置文件，需要大家在配置文件中修改，对就是，利用txt等文本编辑器打开修改。然后这个Galactic Circos做了一个页面的，可以支持在线打开修改配置文件。这里小编就特别想请教一个问题，我想绘制下circos图，然后我看不懂配置文件，然后我利用你这个网页打开，我就看懂了？
最最不能容忍的是，其实这个circos界面话，本来就没有什么意义，作者居然还是利用galaxy进行封装界面化。老大难道你不知道对于很多科研工作者来说 安装galaxy就是一场噩梦吗。
