基因组（genome）是指一个生物体、细胞器或病毒的整套基因。

基因组学（genomics）则以基因组分析为手段，研究基因组的结构组成、时序表达模式（temporal expression pattern）和功能，并提供有关生物物种及其细胞功能的进化信息。

基因组作图（genomic mapping）的目的是确定界标或基因在构成基因组的每条染色体上的位置，以及同条染色体上各个界标或基因之间的相对距离。

工作主要涉及遗传连锁图（genetic linkage map），物理图和表达图（expression map）。

遗传连锁图是用遗传模式来描述DNA标记(基因和其他确定的DNA序列)在染色体上的相对位置。

遗传图的图距单位为厘摩(cM)，1cM代表1％交换率。

物理图是标明一些界标（如限制酶切点、单一序列、基因等）在DNA分子或染色体上所处位置的图，图距以物理长度为单位（如碱基对的数目bp）。

表达图就是基因在不同组织中表达情况（表达量的多少）的图谱。

功能基因组学（functional genomics）：利用结构基因组学研究所得的各种来源的信息，建立与发展各种技术和实验模型来测定基因及基因组非编码序列的生物学功能。

非确定读码（unidentified reading frame，URF）是指DNA序列中识别出的一个可读框，但其生物学功能尚不明确。

直系同源基因（orthologous gene）是指在不同物种之间同源相似的基因，而并系同源基因（paralogous gene）是指一个物种内的同源基因。

蛋白质组（proteome）是指一个基因组中每个基因编码产生的蛋白质的总体，即一个基因组的全部蛋白产物及其表达情况。

转录物组（Transcriptome）：任何一个特定细胞内的全套mRNA；或一个基因组所转录得到的全部mRNA。

转录物组学（ Transcriptomics ）：在转录物组水平上研究mRNA表达谱。