书写日期: 2018年3月24日星期六
今天周末,稍微有点时间,想了想还是写点东西吧。来讲一篇文献好了,白介素2同学就随便搜了一篇,这篇文章发表在 OncoTargets and Therapy(IF=1.653),题为“Identification of differentially expressed genes and signaling pathways in ovarian cancer by integrated bioinformatics analysis”。时间是2018年3月15,就在上个星期发表的
看到这样的题目我们大概就有数了,本文不花钱不做实验且不怎么需要动脑。虽然说分值比较低,用来装逼还是够了的。比如就可以这样用“某某同学在校期间积极参与科研,学术能力突出,取得了突出的科研成果,发表了5篇SCI论文”,然后下面:
然后学术之星登台为学弟学妹们传授经验可以这样:“科研真的很重要,我们决不能只会做手术,那是医匠,我们不能只会学习,只会学习的同学在科研上一般都没什么建树,将来是不会有出息的,balabalabala…”
想当年小编还是有点书生意气,心里嘀咕了一句:“有那么邪乎嘛,看把你能的”。
好了装完逼了,我们还是言归正传,看看这篇SCI究竟做了什么,先看看它的背景和介绍,
这样的Background用脚趾头都能想得到,大概就是说卵巢癌这个疾病怎么怎么严重,然后它的分子机制不清楚,所以我们就写了这篇文章。Results部分又是那些熟悉的关键词,看到这些这篇文章做的就是从GEO数据库下载了3个数据集,然后用DAVID做了GO和KEGG,然后用STRING数据库做了PPI,然后就没有然后了。
我们接着就看看有哪些结果图吧:
这个图你是不是看起来觉得很高级,其实没啥用,就是一个数据处理的过程,这都能算结果了。
然后就是火山图了,其实也没啥用就是看看数据分布的情况。
又是热图,图还不是很好看,明显作者不是专业的生信人员,估计也是跟小编差不多的医学生。
作者这里其实表达的是你看,我在3个数据集都是差异表达哎。
然后就是展示GO的结果了,这个图呢是用clusterprofile这个R包画的,是不是看起来很高大上啊。
还有一个图,其实也差不多,就是展示GO的结果,看看它的分布情况。
然后就是几个表格,再加上一个STRING做的PPI,其实也没啥用,就是让大家看看,还是同样的问题,这个图明显是直接导出的,用cytoscape软件可以做出更漂亮的图。
然后,这种情况作者再加一大段讨论,解释一下,我们分析发现的这些结果其实很牛的,最后就是结论了,看看人家怎么写的
大概就是重复一下,我们做了很多工作,我们发现了一大堆的东西,这些东西很棒哦,你去研究没准能有大发现的,然后就没有然后了……
总结一下,这样的SCI对于专业人员,大概也就是一顿饭的功夫吧,像小编这样非专业的也就是大概三天。当然前期的积累是需要耗费大量的精力,其实个人觉得每一篇论文的发表都需要耗费作者大量的心血,但论文的价值就有待商榷了。其实如果非要这么去做,我们完全能够做得更好嘛,我们完全可以用更大的TCGA数据去验证一下,是不是更有说服力?然后,你就可以不止发5篇SCI了,愉快的装逼了,没准还会被请去传授经验呢。我想想题目就叫“How to publish stupid Chinese index paper and zhuangbi”然后
讲这篇文献的目的当然不是为了让大家去灌水,去当学校的学术之星,相反,祖国的大好青年真的应该实实在在的去做些有意义的事,人体太复杂,对生命应该永远心存敬畏,很多疾病我们还是束手无策,不合理的死亡每天都在发生,现代医学的进步还需要我们来推动,哪怕有一点点也是好的。借用胡适先生的话讲,“少谈些SCI,多研究些问题”。
当然啦,现实还很复杂啦,也不是一两句话能讲清楚的,但至少自己要有理性,日拱一卒,总会有希望的。最后,来句鸡汤吧,前年去世的歌手,莱昂纳德·科恩:万物皆有裂痕,那是光进来的地方,(here is a Crack in Everything, That's How the Light Gets in ),与大家共勉。
今天就聊到这啦,祝大家周末愉快!
TCGA | 小工具 | 数据库 |组装| 注释 | 基因家族 | Pvalue
基因预测 |bestorf | sci | NAR | 在线工具 | 生存分析 | 热图
生信不死 | 初学者 | circRNA | 一箭画心| 十二生肖 | circos
舞台|基因组 | 黄金测序 | 套路 | 杂谈组装 | 进化 | 测序简史