课程梗概
该生物信息学套路主要是基于Cox回归风险模型评估风险标记的预后情况,整个分析套路涉及的数据集比较多,对于每套数据集所对应的部分临床信息没有太完整,导致后续分析的比较性欠缺。重点在于基于单因素Cox回归分析所获得的候选风险标记,根据AIC选择的模型是由几个感兴趣基因构成的风险标记,来检验风险标记的鲁棒性及有效性,选择风险标记模型,才能检验其与临床信息的关联性,证实其作为独立预后因素的有效性。
该套路数据既包含训练集和测试集,还涉及了与癌症相关基因的突变情况进行比较,用风险标记做风险预测的同时,还探讨了与已知致病基因的相关性。
编程语言:R
Keyword:TCGA、GEO、PCA、COX、AIC、生存分析,验证
具体内容:
Part1: 分析流程概述
Part2: 数据获取及预处理
Part3: 自噬基因表达模式的识别
Part4: 自噬相关风险标记的识别
Part5: 自噬相关标记与临床信息的相关性
Part6: 独立预后标志物的识别
Part7: 独立预后标志物的验证
Part8: 癌症预后风险预测
Part9: 风险标记与基因突变的相关性
春节期间(2.5-2.11)
领券价为399
提供全套demo数据和代码
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