今天跟大家介绍一个在线做富集分析的工具Enrichr。

上次给大家推荐富集分析工具的时候，一个关注生信人的同学介绍了这个软件，然后小编今天简单跟大家介绍下这个工具。这个工具的特点就是比较全面，基本上什么信息都包含了，缺点是只有人和小老鼠。

文章提到随着测序成本的降低，得到了越来越多的差异表达的基因和蛋白，对于这些基因和蛋白的深入的功能研究、结构研究以及其他信息的研究更为重要。但是目前已有的注释基因数据库和工具，仍然存在很大的提升空间，因此文章开发了这个Enrichr这个工具，这个工具支持web版、也支持手机端（没找到app）。并且这个工具的好处是整合了35个数据库的数据、提供了多种富集分析排列的方式和多种可视化方式，让你随意玩转富集分析。

Enrichr这个工具的工作流程，首先是你提供基因列表或者文件，然后工具利用已有的35个库将这些基因的富集情况利用表格、网格、网络、柱状图展示。

在这35个数据库中，分别是 transcription, pathways, ontologies, disease/drugs, cell

types, and miscellaneous等6大类，其中有几个是Enrichr特有的数据库, kinase enrichment analysis (KEA)、protein-protein interaction hubs,CORUM等。

富集分析部分工具采用了三种方式进行，第一种是比较常规的利用fisher检验进行计算。第二种就是改进的fisher检验，文章自己开发的利用z-score进行排序。第三种是结合fisher的p值和z-score综合进行排序，一共三种方式。

人的癌症数据富集分析的结果展示。

参考文献

Enrichr: interactive and collaborative HTML5 gene list enrichment analysis tool

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