旁系同源基因就是物种内部的同源基因，直系同源基因则是物种间的同源基因，研究旁系同源基因与直系同源基因有利于基因的进化研究。下面小编就以小麦为例教给大家介绍如何在Ensemble上下载全基因组的旁系同源基因和直系同源基因。

1、进入Ensemble主页：http://asia.ensembl.org/index.html，选择物种分类（该页面最下方）。像小麦，就选择Ensemble Plant

2、进入后选择小麦

3、进入后，选择BioMart

4、进入后选择Plant Mart

5、选择数据集为：小麦

6、点击左上角“Filters”,出现如下界面

7、打开“MULTI SPECIES COMPARISONS”然后勾选 “Homolog filters” ,对于直系同源基因选择相应物种即可，可以是多个物种，本处以选择 “Orthologous Aegilops tauschii Genes” 为例

8、点击左上角 “Attributes” ，选择 “PARALOGS”，为旁系基因，相关输出选项如下，都可以选择输出，包括dn ds都可以

9、也可以选择 “ORTHOLOGS”，为直系同源基因，相关输出选项如下，都可以选择输出，包括dn ds都可以。

10、 点击 “Results” button (top left)，出现如下界面。

11. 选择相应格式输出

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