日期

等级

授课题目

授课内容

第一天

基础

R语言基础知识

1、R语言概述及特点

2、R语言软件安装和功能介绍

3、R语言包的安装和帮助文档

R语言的编程

4、介绍R语言中常用的数据结构（包括向量，数组，矩阵，列表，数据框等）的介绍和操作方法；

5、R语言中数据的导入导出

6、R语言编程中常用的控制语句；

7、R语言中功能模块（函数）的编写和使用方法。

第二天

实战

R绘图基础

8、R绘图的基本概念和模式

9、R语言中常用绘图函数和绘图参数的介绍

10、使用专门的绘图包进行绘图

ggplot2的使用

11、ggplot2软件包概述

12、ggplot2绘制简单图形

13、ggplot2绘制复杂图形，并进行参数调整

第三天

R在统计学中的应用

14、 使用R做统计分析，假设检验，包括常用的参数和非参数检验；

15、使用线性模型进行回归分析；

16、使用R做方差分析；

17、使用R做主成分分析和聚类分析等

（以生物、医学和生态相关内容为例）

第四天

高级

R在生物信息学分析中的应用

18、使用R语言分析转录组测序的read  count数据，进行差异表达分析；

19、使用R进行基因的GO富集分析和Pathway分析等。

课堂答疑

20、具体问题讨论和现场答疑，可以结合学员自身数据和分析需求，设计和编写R语言脚本