生信人公众号昨天的推送专题报道了《自然》杂志上3000余份水稻基因组的文章。除了这些,另一个话题也引起了大家的广泛兴趣——水稻重命名。
有植物基因组学背景的朋友想必都知道,栽培水稻,也即Oryza sativa,主要就是分成两个亚种:一个称作indica,另一个叫作japonica。其主要区别就是indica是长而黏度较低的稻米,而japonica是谷粒短小黏性较大的稻米。不过现在,前者被更名为Oryza sativa subsp. xian,另一个改做Oryza sativa subsp. geng。
从左至右:属于indica的巴斯玛蒂米、泰国香米以及属于japonica的中国东北大米。图片来自网络。
按照林奈(一说最早由瑞士学者Gaspard Bauhin等人最早提出)的双名法原则,生物学物种的学名应由属名+种加词构成,以拉丁文书写。水稻的学名是Oryza sativa。我们拆借一下,sativa的意思是“栽培”,而oryza的意思就是rice。可能你想不到,英文里的rice和拉丁文oryza是“同源”的。在柯林斯字典等网上资源中可以看到,Oryza是拉丁语的写法,后来传到古意大利语中变成了riso,在诺曼底法语(Angolo-French)里变成ris,最后几经周转到了英语里面成了rice。实际上,oryza这个单词也并非起源于拉丁语,我们在希腊语、甚至古老的梵文中都可以找到它的痕迹(vrīhi)【1,2,3】。
水稻的起源一直是学界的热点。有人指出,前面提到的水稻在梵文里的同源词,似乎暗示水稻可能起源于印度【3】。然而,殊不知,中国也是栽种水稻的大国,拥有悠久的水稻栽种历史。关于这个话题,“果壳网”在15年发过一篇非常详尽的文章【3】。这里,小编简而言之,就是我国著名水稻专家丁颖先生力主水稻原产中国,且发现水稻的“籼”、“粳”两大亚种早在汉代就被国人所用。故此,丁颖先生命名了籼和粳两个水稻亚种。几乎是在同一时期,日本学者加藤茂苞独立于丁颖独立发现了籼稻和粳稻的区别,并将籼稻命名为indica(印度型),而将粳稻命名为japonica(日本型)。1930年,indica和japonica的名字被正式发表出来。由于种种原因,籼稻和粳稻的名称未被采纳。
话说回来了,对于这次水稻的改名,同行们似乎也有不同见解。比如,有学者发推支持改名:
新浪网在一篇文章里也为水稻“恢复’中国味’”疯狂打call【5】。支持的理由主要是早先的命名indica和japonica对于水稻的起源、栽培历史和地理分布容易有误导性。
也有人认为,改名没问题。只不过需要注意的是,粳(稻)的标准读音到底应该是jing还是geng。为了求证这个问题,小编特意查询了多款在线字典。这些网络字典无一例外,给出的答案都是jing。也就是说,按照现代字典里标准的读音,应该叫做jing稻。当然了,水稻界都读geng一定也是有原因的。据传,包括袁隆平先生在内的不少水稻专家都读作geng,于是乎久而久之,geng稻的大名就慢慢在圈子里散播开来。关于到底是jing还是geng,2011年三月份《楚天都市报》有一篇报道,题目是《水稻院士张启发认为“粳”字读错了》。有兴趣的读者不妨找来看看,或者也可以看看下面链接里的文章http://cul.china.com.cn/2011-10/26/content_4573909.htm,说的都是同一件事。
此外,还有一种比较激烈的观点,认为改名有多此一举之嫌。持这种观点的朋友的最直接的理据就是,按照《国际植物命名规则》,“学名不能因为名不副实、令人厌恶或其他一些和分类学本身无关的原因被废弃或更改”【3】,改名可能会为大家带来很多麻烦。跟大家最相关的也许就是,现在手头上manuscript里水稻的旧名字要赶紧改一下了。此外,是否一定要按照起源地命名也要打个问号。举个例子,现在全世界通用的阿拉伯数字起源于印度,之所以被称作阿拉伯数字有种种历史原因,似乎改称印度数字——甚至更确切点,应该以古印度文明的源头命名为恒河数字——更为恰当。现代人类是起源于非洲的,那么好了,如果按照起源地命名,智人的拉丁文就要由Homo sapiens变为Homo Africa?而且,非洲有五十多个国家,如果到时候大家争相把自己的名字冠到Homo的后面,一定会忙得不亦乐乎。这个观点似乎有些奇怪,不过小编也是一时语塞不好反驳。
其实,语塞的不光是小编,迷惑的也不只有身边的同行。据悉,在审稿过程中,《自然》杂志的编辑和审稿人都对此次改名持有异议。
据韦朝春透露,因为命名问题,《自然》编辑及文章审稿人曾多次和研究团队沟通,起初并不认可这种修正。“但黎志康老师坚持要把之前的误导性命名改过来,最终说服了对方。”【5】
不过,最终研究团队还是成功说服了编辑和审稿人,使得水稻的命名也成就了一段佳话。
各位读者朋友,关于水稻的新名字,你又怎么看呢?欢迎留言讨论。
参考资料:
https://www.collinsdictionary.com/dictionary/english/rice?showCookiePolicy=true
https://dict.leo.org/forum/viewWrongentry.php?idThread=1243167&idForum=6
https://www.guokr.com/article/440259/
http://finance.sina.com.cn/roll/2018-04-26/doc-ifztkpin2664869.shtml
http://finance.sina.com.cn/roll/2018-04-26/doc-ifztkpin2664869.shtml
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