快上车，性别与肿瘤的研究思路盘点
生信干货
sxr ·2020年3月11日 18:35
2020年 Cancer Research 发表文章Novel Mechanisms of Cancer Emerge When Accounting for Sex as a Biological Variable。提出将性别因素考虑进去，对于肿瘤的发生，预后都非常有必要。 A better understanding of cancer mechanisms, resulting in improved outcomes, will reward the effort invested in incorporating sex as a biological variable. 小编看到这个文章之后，检索了2020年以来的公开数据库挖掘性别和肿瘤预后关系的文章。Sex disparities in head & neck cancer driver genes: An analysis of the TCGA Dataset 
通过TCGA数据库根据男女进行分组，分别关注预后情况，TMB，驱动基因区别，结合HPV信息。可以扩展部分包括细胞浸润情况，驱动基因分布情况等。Sex hormones and genetic variants in hormone metabolic pathwaysassociated with the risk of colorectal cancer
这个文章巧在没有直接按照男女分组，还是选择了性别相关的候选基因集，研究这个候选基因集跟结直肠癌预后的关系，可拓展部分包括风险模型构建，调控网络构建等。Gliomas display distinct sex-based differentialmethylation patterns based on molecular subtype
胶质瘤这篇研究的是男女分组在胶质瘤亚型上甲基化模式上的区别，属于表达谱和甲基化的联合分析，筛选了预后相关的基因和甲基化位点。Pan-cancer immunogenomic analyses reveal sex disparityin the efficacy of cancer immunotherapy European Journal of Cancer
这篇文章是综合研究了TCGA中性别对于各个矮星的免疫治疗情况的评估，重点关注TMB、肿瘤纯度和免疫相关的几个细胞比例。目前相关的此类的文章还不是很多，大家快点上车吧，关注性别与肿瘤预后，免疫治疗，细胞浸润，甲基化等等，凡是合理的都值得挖掘一下。
