国庆七天课(一):TCGA+GTEx联合5+分析课程实操讲解
生信干货
生信人 ·2019年9月26日 19:43
TCGA中AML 只有疾病样本,没有正常样本。同时TCGA中的大部分癌型正常样本都比较少,遇到这个问题的时候,小伙伴们不要过度忧伤,可以参考下这篇做AML的文章,利用的是TCGA的疾病样本和GTEx的正常样本联合分析。整个思路流程如下:数据下载,筛选差异,WGCNA共表达,模块富集分析,预后分析,ceRNA网络构建。这个课程除了有用到两个数据库,同时还出现了WGCNA+ceRNA。值得小伙伴进行下深入学习。
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