数据不够，生信来凑
生信干货
sxr ·2020年3月5日 20:09
目前生信分析，其实就是那么多东西，区别在于你做的好一点，我做的丑一点而已，大多属于锦上添花。还有就是生信分析的价值可大可小，如果绑在大IP身上，丑丑的火山图也是30个点，但是如果绑在烂透了的数据身上，即使是高级的图，水平也就在哪里了。所以很多人说生信貌似发不了很高的分数，这个对也不对。单单的靠生信孤军深入，数据收集和实验验证不打配合的话，不仅仅发不来高分，还有可能被全歼。最近小编看了同一个杂志的两篇文献，可以从这里面帮助大家看看目前生信分析的现状。
Prognostic Values of LDH and CRP in Cervical
Cancer生信的气息浓浓的，一看题目就是单基因预后的套路，做的分析也都在题目里面，简单粗暴。This retrospective study included a total of 150 patients
with locally advanced squamous cell cervical cancer who
were admitted to the Jining Cancer Hospital from 2013 to
2015 and the Affiliated Suzhou Hospital of Nanjing
Medical University in 2015。看完这篇，文章你是不是想说，谁要再说生信不好做，就弄死谁，不就三个图吗，老子描也能描出来。说的有道理，但是要注意数据收集是从13年做的哦。Identification of Novel lncRNA Markers in
Glioblastoma Multiforme and Their Clinical
Significance: A Study Based on Multiple
Sequencing Data 同样也是浓浓的生信气息，但是看题目貌似就高级，又是lncRNA，又是多组学的。我要飞越春夏秋冬，飞越千山万水。。。
这篇文章呢是联合GTEx和TCGA做GBM的ceRNA的，挖掘出lncRNA后还做了qPCR验证（补充材料）
各位，首先说下TCGA+GTEx数据整合，补充正常样本，然后表达谱挖掘，生存分析，风险回归降维，ceRNA网络构建，模型验证等等。虽然这里的ceRNA网络构建也不是真正意义上的ceRNA网络。但是这些分析堆起来绝对是比上一个文章内容多了很多，而且图相对来说也丰富。当然其实还可以更加丰富下。
总结下来呢，如果数据充足，且容易获得，大可不必在生信上死磕高级分析。
如果数据没有，用公开数据，大可不必在生信上死磕高级分析，交给专业的人来做更靠谱。另外不管您是自己有数据，还是没有数据，只要你有分析需求，
